時は江戸時代、町人文化花盛りの江戸の町。町で本屋を営む版元人（出版人）蔦屋重三郎の元には、なにかと町の問題が転がり込んでくる。蔦屋に、絵の才能を買われ絵師として住み込みで働く歌麿とともに、町の問題に挑む毎日。ある日、町を牛耳るヤクザ、邪組（よこしまぐみ）の三代目若頭が蔦屋を訪ねる。邪組は、手広く商売をし町で幅を効かせていたが、組の存在を脅かす動きが起きているというのだ。それは、江戸幕府を影で支えた忍者集団、くノ一の「イタチ」なる集団が、町を一掃するために次々とヤクザを潰しにかかっているというのだ。そんな蔦屋のもとにも、１人の元くノ一が、蔦屋の命を狙いにやってきた。蔦屋は、町の敵とされていた・・・。