高校刑事本郷時貞は、高校で起こるあらゆる事件を解決する高校専門の刑事である。彼が訪れたのは天才のみが通える高校「天才高校」。そこでは全員が学校から何か一つの天才になるように無茶ぶりされる学校。生徒会長と番長の抗争が一触即発の状態になっており、この争いは裏で誰かが糸を引いていると直感する本郷だったが・・・。